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S I B S w i s s I n s t i t u t e o f B i o i n f o r m a t i c s | E x p a s y H o m e A b o u t S I B N e w s C o n t a c t H i d e t h e n e w s P o s t e d I n v a l i d D a t e E x p l o r e h i g h q u a l i t y b i o l o g i c a l d a t a r e s o u r c e s e . g . B L A S T , U n i P r o t , M S H 6 , A l b u m i n . . . 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t S P A R Q L a c c e s s t o t h e R h e a k n o w l e d g e b a s e P r o t e i n s & P r o t e o m e s S y s t e m s B i o l o g y D a t a b a s e P r o t e i n U n i v e r s e A t l a s I n t e r a c t i v e , a n n o t a t e d s i m i l a r i t y n e t w o r k o f a l l p r o t e i n s G e n o m i c s , T r a n s c r i p t o m i c s S o f t w a r e t o o l Q u a s R Q u a n t i f i c a t i o n a n d a n a l y s i s o f S h o r t R e a d s G e n e s & G e n o m e s E v o l u t i o n b i o l o g y S o f t w a r e t o o l B E A S T 2 B a y e s i a n e v o l u t i o n a r y a n a l y s i s b y s a m p l i n g t r e e s G e n o m i c s , T r a n s c r i p t o m i c s S y s t e m s B i o l o g y S o f t w a r e t o o l C R U N C H A u t o m a t e d p i p e l i n e f o r C h I P s e q d a t a a n a l y s i s P r o t e i n s & P r o t e o m e s M e d i c i n a l c h e m i s t r y , S t r u c t u r a l a n a l y s i s S o f t w a r e t o o l S w i s s P a r a m T o p o l o g y a n d p a r a m e t e r s f o r s m a l l m o l e c u l e s S t r u c t u r a l a n a l y s i s S o f t w a r e t o o l O p e n S t r u c t u r e M o l e c u l a r m o d e l l i n g a n d v i s u a l i s a t i o n e n v i r o n m e n t P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l S u l f i n a t o r P r e d i c t t y r o s i n e s u l f a t i o n s i t e s i n p r o t e i n s e q u e n c e s G e n o m i c s P o p u l a t i o n g e n e t i c s S o f t w a r e t o o l V p i p e S A R S C o V 2 V p i p e p i p e l i n e f o r S A R S C o V 2 s e q u e n c i n g d a t a E v o l u t i o n b i o l o g y S o f t w a r e t o o l R E A L P H Y I n f e r e n c e o f p h y l o g e n e t i c t r e e s f r o m g e n o m e d a t a M e d i c i n a l c h e m i s t r y S o f t w a r e t o o l S w i s s S i m i l a r i t y L i g a n d b a s e d v i r t u a l s c r e e n i n g G e n o m i c s , T r a n s c r i p t o m i c s S o f t w a r e t o o l m i R m a p P r e d i c t i o n o f m i c r o R N A t a r g e t r e p r e s s i o n s t r e n g t h P r o t e i n s & P r o t e o m e s D a t a b a s e n e X t P r o t S P A R Q L e n d p o i n t S P A R Q L a c c e s s t o t h e n e X t P r o t h u m a n p r o t e i n k n o w l e d g e b a s e G l y c o m i c s S o f t w a r e t o o l G l y d i n N e t w o r k r e p r e s e n t a t i o n o f k n o w n g l y c a n d e t e r m i n a n t s G e n o m i c s S o f t w a r e t o o l P A C M A N P u b l i c a t i o n q u a l i t y i m a g e s o f D N A l o c a t i o n s G l y c o m i c s D a t a b a s e U n i C a r b D B G l y c a n s t r u c t u r e s a n d a s s o c i a t e d m a s s s p e c t r o m e t r y d a t a T r a n s c r i p t o m i c s E v o l u t i o n b i o l o g y D a t a b a s e B g e e S P A R Q L e n d p o i n t S P A R Q L a c c e s s t o t h e B g e e g e n e e x p r e s s i o n d a t a b a s e P r o t e i n s & P r o t e o m e s S y s t e m s B i o l o g y D a t a b a s e S T R I N G S P A R Q L e n d p o i n t S P A R Q L a c c e s s t o t h e S T R I N G k n o w l e d g e b a s e G e n e s & G e n o m e s S y s t e m s B i o l o g y S o f t w a r e t o o l C R E M A C R E M A : C i s R e g u l a t o r y E l e m e n t M o t i f A c t i v i t i e s G e n e s & G e n o m e s , G e n o m i c s S y s t e m s B i o l o g y D a t a b a s e S o f t w a r e t o o l P r o g e n e t i x G e n o m i c p r o f i l e s o f c a n c e r s a m p l e s w i t h f o c u s o n C N V G e n e s & G e n o m e s S o f t w a r e t o o l E S T s c a n D e t e c t c o d i n g r e g i o n s i n E S T s e q u e n c e s P r o t e i n s & P r o t e o m e s M e d i c i n a l c h e m i s t r y , S t r u c t u r a l a n a l y s i s S o f t w a r e t o o l S w i s s T a r g e t P r e d i c t i o n T a r g e t p r e d i c t i o n f o r b i o a c t i v e s m a l l m o l e c u l e s P o p u l a t i o n g e n e t i c s S o f t w a r e t o o l A r l e q u i n A n i n t e g r a t e d s o f t w a r e f o r p o p u l a t i o n g e n e t i c s d a t a a n a l y s i s S y s t e m s B i o l o g y D a t a b a s e C e l l o s a u r u s S P A R Q L e n d p o i n t S P A R Q L a c c e s s t o C e l l o s a u r u s v i a W i k i d a t a P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l D o t l e t R e g i o n s o f c l o s e s i m i l a r i t y i n 2 s e q u e n c e s E v o l u t i o n & P h y l o g e n y D a t a b a s e O r t h o D B O r t h o l o g e v o l u t i o n a r y a n d f u n c t i o n a l a n n o t a t i o n s G e n o m i c s , T r a n s c r i p t o m i c s S y s t e m s B i o l o g y D a t a b a s e S w i s s R e g u l o n D a t a b a s e o f g e n o m e w i d e a n n o t a t i o n s o f r e g u l a t o r y s i t e s T r a n s c r i p t o m i c s D a t a b a s e P o l y A s i t e D a t a b a s e o f c u r a t e d R N A p o l y a d e n y l a t i o n s i t e s P r o t e i n s & P r o t e o m e s G l y c o m i c s S o f t w a r e t o o l G l y c o M o d P o s s i b l e o l i g o s a c c h a r i d e s t r u c t u r e s o n p r o t e i n s f r o m m a s s e s P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l D e c r e a s e r e d u n d a n c y R e d u n d a n c y r e d u c t i o n i n a s e t o f s e q u e n c e s M e t a b o l o m i c s S o f t w a r e t o o l M S i g h t M a s s S p e c t r o m e t r y I m a g e r G e n o m i c s E v o l u t i o n b i o l o g y S o f t w a r e t o o l B U S C O F r o m Q C t o g e n e p r e d i c t i o n a n d p h y l o g e n o m i c s S y s t e m s B i o l o g y S o f t w a r e t o o l G e n o m e H i s t o r y G e n e d u p l i c a t e i d e n t i f i c a t i o n G e n e s & G e n o m e s E v o l u t i o n & P h y l o g e n y S o f t w a r e t o o l B E A S T 2 C O V I D 1 9 M o n i t o r i n g E p i d e m i o l o g i c a l d y n a m i c s i n r e a l t i m e P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l C o m p u t e p I / M W I s o e l e c t r i c p o i n t a n d m o l e c u l a r w e i g h t f r o m p r o t e i n s e q u e n c e E v o l u t i o n & P h y l o g e n y S o f t w a r e t o o l r a x m l G U I r a x m l G U I 2 . 0 i s a g r a p h i c a l u s e r i n t e r f a c e t o R A x M L P r o t e i n s & P r o t e o m e s D a t a b a s e P R O S I T E P r o t e i n f a m i l y a n d d o m a i n d a t a b a s e P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l U n i P r o t B L A S T B L A S T s e q u e n c e s i m i l a r i t y s e a r c h o n t h e U n i P r o t w e b s i t e G e n o m i c s , T r a n s c r i p t o m i c s S o f t w a r e t o o l T r o m E R P r e d i c t i o n o f t r a n s c r i b e d r e g i o n s a n d s p l i c e j u n c t i o n s P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l M y r i s t o y l a t o r N t e r m i n a l m y r i s t o y l a t i o n o f p r o t e i n s b y n e u r a l n e t w o r k s P r o t e i n s & P r o t e o m e s G l y c o m i c s D a t a b a s e U n i L e c t i n S t r u c t u r a l a n d f u n c t i o n a l c l a s s i f i c a t i o n o f l e c t i n s P r o t e i n s & P r o t e o m e s S t r u c t u r a l B i o l o g y D a t a b a s e S W I S S M O D E L R e p o s i t o r y P r o t e i n s t r u c t u r e h o m o l o g y m o d e l s G e n o m i c s , T r a n s c r i p t o m i c s D a t a b a s e G l i t t r G i t r e p o s i t o r i e s w i t h b i o i n f o r m a t i c s t r a i n i n g m a t e r i a l G e n o m i c s E v o l u t i o n b i o l o g y S o f t w a r e t o o l C T C B N E s t i m a t e c o n j u n c t i v e B a y e s i a n n e t w o r k s G e n o m i c s S o f t w a r e t o o l M A D A P C l u s t e r i n g t o o l o f g e n o m i c s i t e s P r o t e i n s & P r o t e o m e s S t r u c t u r a l B i o l o g y , S t r u c t u r a l a n a l y s i s S o f t w a r e t o o l S W I S S M O D E L W o r k s p a c e F u l l y a u t o m a t e d p r o t e i n s t r u c t u r e h o m o l o g y m o d e l i n g s e r v e r P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l S c a n P r o s i t e P r o t e i n s e q u e n c e s a g a i n s t P R O S I T E P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l P r o t S c a l e P r o f i l e p r o d u c e d b y a m i n o a c i d s s c a l e s o n p r o t e i n s e q u e n c e s P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l P R A T T C o n s e r v e d p a t t e r n s i n a s e t o f p r o t e i n s e q u e n c e s G e n e s & G e n o m e s P r o t e i n s & P r o t e o m e s E v o l u t i o n & P h y l o g e n y , E v o l u t i o n b i o l o g y S o f t w a r e t o o l O r t h o L o g e r A c c u r a t e a n d s c a l a b l e i n f e r e n c e o f g r o u p s o f o r t h o l o g s P r o t e i n s & P r o t e o m e s S t r u c t u r a l B i o l o g y D a t a b a s e S o f t w a r e t o o l C A M E O W e e k l y a u t o m a t e d b e n c h m a r k i n g o f p r o t e i n s t r u c t u r e m o d e l l i n g P r o t e i n s & P r o t e o m e s D a t a b a s e V e n o m Z o n e P o r t a l t o v e n o m p r o t e i n U n i P r o t K B e n t r i e s M e d i c i n a l c h e m i s t r y , S t r u c t u r a l a n a l y s i s D a t a b a s e S w i s s S i d e c h a i n D a t a b a s e o f n o n n a t u r a l a m i n o a c i d s i d e c h a i n s G e n o m i c s S o f t w a r e t o o l S S A A n a l y s i s o f n u c l e i c a c i d s e q u e n c e m o t i f s P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l p R O C V i s u a l i z e , s m o o t h a n d c o m p a r e R O C c u r v e s E v o l u t i o n & P h y l o g e n y D a t a b a s e S w i s s T r e e s A c o l l e c t i o n o f g o l d s t a n d a r d g e n e p h y l o g e n i e s G e n e s & G e n o m e s D a t a b a s e S o f t w a r e t o o l S P S P | S w i s s P a t h o g e n S u r v e i l l a n c e P l a t f o r m A s e c u r e N G S O n e h e a l t h o n l i n e p l a t f o r m P r o t e i n s & P r o t e o m e s S y s t e m s B i o l o g y D a t a b a s e M e t a N e t X S P A R Q L e n d p o i n t S P A R Q L a c c e s s t o M e t a N e t X T e x t m i n i n g & M a c h i n e l e a r n i n g D a t a b a s e S I B i L S S P A R Q L e n d p o i n t S P A R Q L a c c e s s t o S I B i L S , t h e S I B L i t e r a t u r e S e r v i c e s P r o t e i n s & P r o t e o m e s D a t a b a s e U n i P r o t S P A R Q L e n d p o i n t S P A R Q L a c c e s s t o U n i P r o t a n d r e l a t e d d a t a G e n o m i c s S y s t e m s B i o l o g y D a t a b a s e S o f t w a r e t o o l a r r a y M A P C u r a t e d a r r a y d a t a r e p o s i t o r y f o r c a n c e r g e n o m i c s G e n e s & G e n o m e s P r o t e i n s & P r o t e o m e s E v o l u t i o n & P h y l o g e n y S o f t w a r e t o o l O M A r k O M A r k d e t e r m i n e s t h e q u a l i t y a n d c o m p l e t e n e s s o f g e n e s e t s S y s t e m s B i o l o g y , G l y c o m i c s S o f t w a r e t o o l H M O G l y c o l o g u e S i m u l a t o r o f H u m a n M i l k O l i g o s a c c h a r i d e s y n t h e s i s G e n o m i c s P r o t e i n s & P r o t e o m e s D a t a b a s e A B C D D a t a b a s e o f c h e m i c a l l y d e f i n e d a n t i b o d i e s G e n o m i c s , T r a n s c r i p t o m i c s P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l T r a n s l a t e N u c l e o t i d e s e q u e n c e t o a p r o t e i n s e q u e n c e G l y c o m i c s D a t a b a s e G A G D B 3 D s t r u c t u r e s o f g l y c o s a m i n o g l y c a n s P r o t e i n s & P r o t e o m e s S t r u c t u r a l a n a l y s i s S o f t w a r e t o o l Q M E A N P r o t e i n m o d e l q u a l i t y e s t i m a t i o n P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l P e p t i d e M a s s T h e o r e t i c a l p r o t e i n c l e a v a g e b y a g i v e n e n z y m e P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l p f t o o l s B u i l d , c a l i b r a t e , a n d s e a r c h b i o l o g i c a l s e q u e n c e s P r o t e i n s & P r o t e o m e s D a t a b a s e E N Z Y M E E n z y m e n o m e n c l a t u r e d a t a b a s e G e n o m i c s S o f t w a r e t o o l T A S e r S e a r c h t o o l a s s o c i a t e d t o T A S m a n i a G e n e s & G e n o m e s , G e n o m i c s T e x t m i n i n g & M a c h i n e l e a r n i n g D a t a b a s e c a n c e r c e l l l i n e s . o r g G e n o m i c v a r i a n t s i n h u m a n c a n c e r c e l l l i n e s G e n o m i c s D a t a b a s e T A S m a n i a T o x i n a n t i t o x i n d a t a b a s e G e n o m i c s S o f t w a r e t o o l T a g S c a n G e n o m e w i d e s e q u e n c e t a g s c a n n e r G e n o m i c s D a t a b a s e E P D E u k a r y o t i c P r o m o t e r D a t a b a s e P r o t e i n s & P r o t e o m e s S o f t w a r e t o o l U n i P r o t C l u s t a l O A l i g n t w o o r m o r e p r o t e i n s e q u e n c e s P r o t e i n s & P r o t e o m e s S t r u c t u r a l B i o l o g y , D r u g d e s i g n , M e d i c i n a l c h e m i s t r y , S t r u c t u r a l a n a l y s i s S o f t w a r e t o o l C l i c k 2 D r u g D i r e c t o r y o f c o m p u t a t i o n a l d r u g d e s i g n t o o l s G l y c o m i c s S o f t w a r e t o o l G l y C o n n e c t C o m p o z i t o r C o n t e x t u a l i s e s g l y c a n c o m p o s i t i o n s e t s T e x t m i n i n g & M a c h i n e l e a r n i n g D a t a b a s e S o f t w a r e t o o l S I B i L S P e r s o n a l i z e d I n f o r m a t i o n R e t r i e v a l i n b i o m e d i c a l l i t e r a t u r e P r o t e i n s & P r o t e o m e s D a t a b a s e H A M A P S P A R Q L e n d p o i n t S P A R Q L a c c e s s t o t h e H A M A P a n n o t a t i o n r u l e s E v o l u t i o n b i o l o g y S o f t w a r e t o o l C A P T A I N D e c i s i o n s u p p o r t t o o l f o r c o n s e r v a t i o n a r e a p r i o r i t i z a t i o n P r o t e i n s & P r o t e o m e s M e d i c i n a l c h e m i s t r y , S t r u c t u r a l a n a l y s i s D a t a b a s e S w i s s B i o I s o s t e r e D a t a b a s e o f m o l e c u l a r r e p l a c e m e n t s f o r l i g a n d d e s i g n P r o t e i n s & P r o t e o m e s D a t a b a s e U n i P r o t K B P r o t e i n s e q u e n c e d a t a b a s e P r o t e i n s & P r o t e o m e s D a t a b a s e S o f t w a r e t o o l P a x D b P r o t e i n a b u n d a n c e a c r o s s s e v e r a l o r g a n i s m s E x p a s y i s o p e r a t e d b y t h e S I B S w i s s I n s t i t u t e o f B i o i n f o r m a t i c s | T e r m s o f U s e B a c k t o t h e t o p

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